Câu chuyện bắt đầu khi Suzume vô tình gặp chàng trai Souta đến thị trấn nơi cô sinh sống với mục đích tìm kiếm "một cánh cửa". Để bảo vệ Nhật Bản khỏi thảm họa, những cánh cửa rải rác khắp nơi ...